こちらはCellのVol.182, Issue 4の表紙です。この表紙の絵は、アルツハイマー病（AD）に伴うアミロイド斑が示す複雑な細胞間インターアクションを示しているそうです。
それを明らかにしたのがSpatial、空間的遺伝子発現解析とシングルセル。
Chen et. al., Spatial Transcriptomics and In Situ Sequencing to Study Alzheimer’s Disease（https://doi.org/10.1016/j.cell.2020.06.038）PMID 32702314
こちらハイライトを訳すと、
- プラーク誘発遺伝子（PIG）のネットワークを空間トランスクリプトームで解明した
- 空間トランスクリプトミクスによってADにおけるオリゴデンドロサイト遺伝子（OLIG）応答を同定した
- マウスおよびヒトのin situ配列決定により、これらの応答がシングルセルレベルで確認された
- PIGとOLIGの反応は異なる神経変性疾患においても保存されている
とのことです。
今月はアルツハイマー月間、９月２１日は世界アルツハイマーデーだそうです。
高齢化がますます進む日本で、アルツハイマー病は人ごとでは無くなってきているでしょう。一般的に、認知症と混同されがちですが、認知症は病気ではなく状態のことです。ICD-10（国際疾病分類10版）による認知症の定義は、「通常、慢性あるいは進行性の脳疾患によって生じ、記憶・思考・見当識・理解・計算・学習・言語・判断等多数の高次脳機能の障害からなる症候群」だそうです。
アルツハイマー病は認知症を引き起こす脳の病気のひとつ、です。
平成２８年度の厚生労働省白書によると、２０１４年の国内のアルツハイマー病の患者数は推計５３万人。
さて、先のCellの論文です。有料論文なので中身は書けませんが、このような脳の研究にはSpatialな解析が必須になってくると思います。何の遺伝子がどこで発現していたのか、それが他の遺伝子とどう関係していたのか、などを空間的に理解することがますます必要とされるでしょうね。
