第８０回 日本癌学会学術総会

10月になり、朝晩は涼しくなってきましたね（東京）。今日は三日月

今年の癌学会は初日の9月30日が緊急事態宣言最終日、2日目の10月1日が台風で暴風雨、3日目になってようやく晴れるという、現地参加者にとってはなかなか厳しい日程でした。

私たちはブースも出して3日目にランチョンも行ったので通しで現地にいました。皆さんも知っているかもしれませんがパシフィコ横浜は、会議場と展示会場が少し離れています。移動するには一旦外に出ないといけないので（裏技はあるんだけど）、2日目は暴風雨のせいでほとんど展示会場に人は来ませんでした。

コロナ下での学会はほとんどがハイブリッド。その中で現地に来る研究者はどれくらいいるんだろう？って、始まるまでずーっと心配でしたが、会議場の方は意外とたくさんの人が現地参加していました。事務局発表では1,500名が現地参加、リモート参加が1,700名だったらしいです。

ほとんどの大きなセッションはオンデマンドもあるのでこれから参加する人も結構いるんでしょうかね。

今回は展示会場もかなりソーシャルディスタンス。ブースとブースの間が広々していましたが展示企業の数は少なかったですね。

そうです、今回Chromium X の実機を初めて公開しました！

向かって左側がX  右側が今までのController

今回の癌学会で特に思ったのは、シングルセルの発表が多かったこと。

私もツイッターで呟いていましたけれど、明らかにRNAシーケンスはバルクからシングルセルに移っているように感じました（もちろんバルクで十分な実験もあるけど）。今回Single Cellでタイトルを検索すると38の発表があったことがわかりました。実際はタイトルにはSingle Cellと書いていなくても手法としてシングルセルを使っていた発表もあったと思うから実数はそれよりはるかに多いと思います。（その38の発表はこちらにリストでまとめました）

特に以下の3つのセッションはシングルセルとマルチオミックス がメインテーマでした。おすすめです（全てオンデマンドあり）

• CS2　一細胞解像度のがん生物学
• IC10　がんのシングルセル・空間トランスクリプトーム解析
• IS11　がん研究における一細胞解析

オンデマンドは10月18日から11月12日までだそうです。

AGBT ハイライト 10x Genomics

毎年この時期恒例のAGBTですが、私は行っていませんけれどもまるで行ったかのような報告をします（笑）。PacBioの時もそうでしたね

10x Genomics のプレゼンは月曜日の午後。多くの人が注目している中で行われました。
数々の新製品のアナウンスの他、自動ライブラリ作製装置「Chromium Connect」が出荷されたことも発表されました。

このページに詳しく書いています。
シングルセルの新製品とVisiumの新製品についての発表。
簡単にまとめると、まずシングルセルの新製品は、

• Chromium Single CellのATACとGene Expressionを同じ細胞から同時に見れるようになる。これがやりたかった人は多いのではないでしょうか？
• CellPlex：８チャネルチップを用いた時、１ランあたり最大16万細胞または96サンプル処理することができるようになる。実験のスケールに応じてサンプル数を調整することが可能です。CellPlex＝細胞マルチプレックス

Visiumの新製品については

• IHC（免疫組織化学）に対応：タンパク質と遺伝子発現を同じ組織上で同時に観察できるようになる
• Feature Barcodeテクノロジーに対応：こちらは数千種類ものタンパク質の発現と遺伝子発現を同じ組織で同時に観察できるようになる
• FFPE組織に対応：今は凍結切片のみ対応のVisium実験をFFPEサンプルからでもできるようになる

以上、リリース時期はまだ明らかにしていませんが、近い将来製品化されるものです。

いかがでしょうか。ワクワクしてきましたね。

シングルセルゲノミクス研究会 発足！

新しい学会・研究会のお知らせです！

NGS現場の会に行ったことがある方はわかると思いますが、初心者からプロまで一堂に集まり、学会や研究テーマの枠を超えて、最新技術の使い方や使ってみた感想などを、普通の発表に加えてざっくばらんに話し合う、そういう雰囲気の場はいいですよね。
最新技術と言えば、今は、シングルセル解析！　
というのは過言ですけど、その現場の会の雰囲気が再び帰ってきました。

その名も「シングルセルゲノミクス研究会」略してSCG

ウェブサイトはここ
京都大学の渡辺先生が中心となりこのような会が出来上がりました。
第１回の集まりは8月29日（木）〜30日（金）の２日間。場所は柏の葉カンファレンスセンター。

この場所はつくばエキスプレスに乗って柏の葉キャンパスで降りると、そこから徒歩で１、２分です。三井ガーデンホテルと同じ建物にあります。

現場の会と同じように、基本はみんなフラットな関係で、アカデミアもコマーシャルも、初心者もエキスパートも、分け隔てなくディスカッションができる場になると思います。

スポンサー企業の方々もその辺は理解して出展するでしょう。私たち10xはランチョンを行います。今から楽しみ！

プログラムは、こちらに随時アップされていくようです。
特別講演、招待講演はこの道の達人が勢揃いですね。

ポスター発表、口頭発表は募集制です。既に多くの人が発表を希望しているそうです。

参加登録はこちら

参加費は、発表するかたは無料（ただし上限枠があると思うので希望者は早めに登録する方が良いと思います）
発表無しでもそこそこ安い価格ではないでしょうかね？　ほかの学会と比べて。

ここに来ればシングルセルの全てがわかる！というキャッチフレーズがあるように、このような会は貴重だと思います。特に新しいテクノロジーが普及する過程において。

私もランチョンスポンサーという形で参加しますが同時にたくさん勉強させて頂こうと思います。
なので、皆さんも、

• 自分の研究にシングルセルが本当に適しているのか正直わからない
• これからやろうとしている手法が王道なのか邪道なのかはっきりさせたい
• そもそもシングルセルで何がわかるのか知りたい

そんな疑問を持っているならぜひ参加するべきだと思います。
せっかくたくさんのエキスパートの先生方もいることだし、またいろんなシングルセル関連の企業も来ているので、きっとどこかで解決、または解決に至るヒントが得られると思います。
（私も正直、疑問を抱えていまして、それをある人に聞きたい）

来月ですので早めに登録することをオススメします。
あと、地方から参加される方は、ホテルは柏の葉キャンパス近辺か、つくばエクスプレスの都心側の駅に取った方が良いと思います（つくば側だと朝夕のラッシュに巻き込まれる。都心側なら逆方向だから空いている）。


P.S.　29日の夜にはネットワーキングがあるので、そこで軽く飲みながら研究のことを話すのもいいでしょうね。

EMBOとHCA 東京お台場にて

今週、5月20日から24日にかけて、EMBOシングルセルワークショップ（20日〜22日）、Human Cell Atlas General Meeting（23日、24日）がありました。これは国際学会。ということで本社からもCEOをはじめスタッフが数名来日しました。

私はマーケ担当なのでこういうブースとかを代理店さん（スクラムさん）と作ったり、

我々のブース

 こういうGiveawayとか、

これはUSBです

ブースでのLucky Draw（くじ引きなどでプレゼントが当たるアレ）を企画したり、
みんなで写真を撮ってシンガポールに送ってSNS（ツイッター）に載せてもらったり、

私もちゃっかり写ってます。私の隣の隣の隣がCEOです。

スポンサードトークのテーマはSingle Cell Immunologyで、本社VPに話してもらいました

ランチョンセミナーでは本社のプロダクトマネージャーに話してもらいました。司会は私。ちょっと緊張した

こんなことを行っていました。

みんなブースでのお客さん対応も行っていたから、終わって、どっと疲れが。
EMBOはこのような内容　ウェブサイト
でした。ツイッターの　#EMBOsinglecellbio  #humancellatlasのタグも追って見ると面白いですよ。
EMBOは事務局発表によると320名（167名は日本から、153名は海外から）が参加されたそうです. 

HCAでもそうでしたが、シングルセル解析はだんだんSpatialな情報の発表も多くなってきました。これは組織の「どこで」発現していたのかを大規模に知ることが技術的に可能になってきたおかげです。10xでもこの分野はいち早く取り込み、Spatial Transcriptomics社の買収によって今後大きな貢献をすることになるでしょう。今から楽しみです。


さて、私たちは6月28日（金）、東京秋葉原で10xユーザーグループミーティングを行います。国際ゲノム会議の翌日です。こちらもぜひお楽しみに！
詳しくはこちらを参照ください！